Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna2d3Q9Z1L5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms