Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf1Q9Z1B8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms