Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NgfrQ9Z0W1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms