Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cib1Q9Z0F4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms