Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms