Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms