Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms