Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms