Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zeb2Q9R0G7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Zeb2Q9R0G7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Zeb2Q9R0G7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zeb2Q9R0G7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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