Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc3Q9QZC1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms