Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms