Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms