Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms