Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME2

Chst11, Carbohydrate sulfotransferase 11, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst11Q9JME2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chst11Q9JME2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chst11Q9JME2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms