Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tgm1Q9JLF6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tgm1Q9JLF6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tgm1Q9JLF6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tgm1Q9JLF6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms