Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Tmod2Q9JKK7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Tmod2Q9JKK7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmod2Q9JKK7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms