Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms