Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms