Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms