Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms