Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms