Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms