Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms