Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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