Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms