Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tlr1Q9EPQ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tlr1Q9EPQ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tlr1Q9EPQ1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tlr1Q9EPQ1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tlr1Q9EPQ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tlr1Q9EPQ1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tlr1Q9EPQ1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tlr1Q9EPQ1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms