Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms