Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r52Q9EP79 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms