Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms