Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms