Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms