Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms