Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms