Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med11Q9D8C6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms