Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms