Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms