Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms