Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc105Q9D4K7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms