Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcc1Q9D4H2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms