Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms