Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms