Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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