Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ift27Q9D0P8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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