Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms