Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms