Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms