Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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