Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms