Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ly6kQ9CWP4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6kQ9CWP4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms