Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pfdn1Q9CWM4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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